MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 82625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014330	AGA	2	6	3	8	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014330	AAT	2	6	9	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014330	GTG	2	6	27	32	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014330	ATT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014330	AT	3	6	115	120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014330	ATAA	2	8	124	131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014330	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014330	TGA	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014330	ATA	2	6	253	258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014330	GAA	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014330	AAAAG	2	10	265	274	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014330	AT	3	6	313	318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014330	TGT	2	6	327	332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014330	TAA	2	6	344	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014330	ATA	2	6	373	378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014330	GAG	2	6	394	399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014330	A	6	6	493	498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014330	A	6	6	514	519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014330	CAG	2	6	542	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014330	ATG	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014330	AT	4	8	554	561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014330	GAT	3	9	652	660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014330	ATTA	2	8	675	682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014330	ATT	2	6	695	700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014330	ATT	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014330	TGG	2	6	747	752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014330	T	8	8	773	780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014330	AAT	2	6	781	786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014330	TTAT	2	8	805	812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014330	GAT	3	9	829	837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014330	T	6	6	844	849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014330	TTA	2	6	859	864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014330	AAT	2	6	895	900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014330	ATA	2	6	904	909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014330	ATG	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014330	ATAA	2	8	946	953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014330	ATT	2	6	984	989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014330	TAT	2	6	994	999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014330	TGAT	2	8	1029	1036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014330	TAA	2	6	1048	1053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014330	ATT	2	6	1085	1090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014330	TA	3	6	1115	1120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014330	A	6	6	1133	1138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014330	ATTTTT	2	12	1145	1156	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014330	T	7	7	1152	1158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014330	A	6	6	1161	1166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014330	T	6	6	1208	1213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014330	AGA	2	6	1222	1227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
49	NC_014330	AGA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
50	NC_014330	ATTA	2	8	1249	1256	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
51	NC_014330	A	6	6	1320	1325	100 %	0 %	0 %	0 %	300869641
52	NC_014330	TA	3	6	1341	1346	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
53	NC_014330	A	6	6	1407	1412	100 %	0 %	0 %	0 %	300869641
54	NC_014330	GAA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
55	NC_014330	AGA	2	6	1459	1464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
56	NC_014330	TTGGGG	2	12	1510	1521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300869641
57	NC_014330	ATA	2	6	1529	1534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
58	NC_014330	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
59	NC_014330	AAAT	2	8	1573	1580	75 %	25 %	0 %	0 %	300869641
60	NC_014330	ATT	3	9	1611	1619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
61	NC_014330	AT	3	6	1672	1677	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
62	NC_014330	AT	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
63	NC_014330	TAG	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
64	NC_014330	AATAA	2	10	1802	1811	80 %	20 %	0 %	0 %	300869641
65	NC_014330	TA	3	6	1839	1844	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
66	NC_014330	T	8	8	1911	1918	0 %	100 %	0 %	0 %	300869641
67	NC_014330	ATA	2	6	1940	1945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
68	NC_014330	A	9	9	1947	1955	100 %	0 %	0 %	0 %	300869641
69	NC_014330	TA	3	6	1956	1961	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
70	NC_014330	ATT	2	6	2038	2043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
71	NC_014330	AGA	2	6	2058	2063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
72	NC_014330	ATG	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
73	NC_014330	TAGA	2	8	2082	2089	50 %	25 %	25 %	0 %	300869641
74	NC_014330	AGCA	2	8	2103	2110	50 %	0 %	25 %	25 %	300869641
75	NC_014330	A	6	6	2141	2146	100 %	0 %	0 %	0 %	300869641
76	NC_014330	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
77	NC_014330	A	7	7	2187	2193	100 %	0 %	0 %	0 %	300869641
78	NC_014330	TGA	2	6	2194	2199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
79	NC_014330	ATT	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
80	NC_014330	AAATT	2	10	2246	2255	60 %	40 %	0 %	0 %	300869641
81	NC_014330	ATT	2	6	2278	2283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
82	NC_014330	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
83	NC_014330	TGA	2	6	2299	2304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
84	NC_014330	AT	3	6	2305	2310	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
85	NC_014330	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
86	NC_014330	TAA	2	6	2365	2370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
87	NC_014330	TGG	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300869641
88	NC_014330	AAG	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
89	NC_014330	AGACC	10	50	2432	2481	40 %	0 %	20 %	40 %	300869641
90	NC_014330	TAA	2	6	2482	2487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
91	NC_014330	TAA	2	6	2516	2521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014330	A	6	6	2532	2537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014330	A	6	6	2558	2563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014330	T	6	6	2575	2580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014330	A	6	6	2606	2611	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
96	NC_014330	ATA	2	6	2632	2637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
97	NC_014330	TGG	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300869642
98	NC_014330	A	6	6	2685	2690	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
99	NC_014330	A	7	7	2697	2703	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
100	NC_014330	AGA	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869642
101	NC_014330	AAAAT	2	10	2729	2738	80 %	20 %	0 %	0 %	300869642
102	NC_014330	TAA	2	6	2781	2786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
103	NC_014330	A	6	6	2785	2790	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
104	NC_014330	A	6	6	2799	2804	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
105	NC_014330	ATTT	2	8	2812	2819	25 %	75 %	0 %	0 %	300869642
106	NC_014330	T	6	6	2856	2861	0 %	100 %	0 %	0 %	300869642
107	NC_014330	AT	3	6	2865	2870	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
108	NC_014330	GTTTT	2	10	2932	2941	0 %	80 %	20 %	0 %	300869642
109	NC_014330	T	6	6	2938	2943	0 %	100 %	0 %	0 %	300869642
110	NC_014330	AT	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
111	NC_014330	ATT	3	9	2990	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
112	NC_014330	AGA	2	6	3009	3014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869642
113	NC_014330	T	7	7	3015	3021	0 %	100 %	0 %	0 %	300869642
114	NC_014330	ATT	3	9	3053	3061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
115	NC_014330	TAA	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
116	NC_014330	A	6	6	3110	3115	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
117	NC_014330	AG	3	6	3155	3160	50 %	0 %	50 %	0 %	300869642
118	NC_014330	AAT	2	6	3163	3168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
119	NC_014330	TA	3	6	3176	3181	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
120	NC_014330	TA	3	6	3189	3194	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
121	NC_014330	TA	3	6	3221	3226	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
122	NC_014330	T	7	7	3237	3243	0 %	100 %	0 %	0 %	300869642
123	NC_014330	TAA	2	6	3273	3278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
124	NC_014330	ATT	2	6	3302	3307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
125	NC_014330	TAA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
126	NC_014330	ATTTTA	2	12	3320	3331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
127	NC_014330	ATATA	2	10	3429	3438	60 %	40 %	0 %	0 %	300869642
128	NC_014330	GTA	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869642
129	NC_014330	AGA	3	9	3465	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869642
130	NC_014330	TAA	2	6	3495	3500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
131	NC_014330	A	6	6	3499	3504	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
132	NC_014330	ATA	2	6	3508	3513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
133	NC_014330	ATT	2	6	3543	3548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
134	NC_014330	TTAT	2	8	3549	3556	25 %	75 %	0 %	0 %	300869642
135	NC_014330	TAA	2	6	3558	3563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
136	NC_014330	AGT	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869642
137	NC_014330	GGA	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300869642
138	NC_014330	A	6	6	3688	3693	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
139	NC_014330	T	6	6	3768	3773	0 %	100 %	0 %	0 %	300869642
140	NC_014330	AT	3	6	3794	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
141	NC_014330	TTAA	2	8	3832	3839	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
142	NC_014330	ATTT	2	8	3846	3853	25 %	75 %	0 %	0 %	300869642
143	NC_014330	TAATT	2	10	3869	3878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014330	TAA	2	6	3880	3885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014330	ATA	2	6	3895	3900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014330	TTA	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_014330	TCC	2	6	8042	8047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300869646
287	NC_014330	TAA	2	6	8059	8064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
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289	NC_014330	ATA	2	6	8125	8130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
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300	NC_014330	AGAT	2	8	8527	8534	50 %	25 %	25 %	0 %	300869646
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406	NC_014330	TAA	2	6	11518	11523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_014330	ATA	2	6	11619	11624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869651
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414	NC_014330	ATT	3	9	11955	11963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869651
415	NC_014330	AAT	2	6	11975	11980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869651
416	NC_014330	A	6	6	12031	12036	100 %	0 %	0 %	0 %	300869651
417	NC_014330	CTTTTG	2	12	12039	12050	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	300869651
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419	NC_014330	T	6	6	12130	12135	0 %	100 %	0 %	0 %	300869651
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451	NC_014330	CTT	2	6	13199	13204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869651
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455	NC_014330	A	6	6	13352	13357	100 %	0 %	0 %	0 %	300869651
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489	NC_014330	A	6	6	14182	14187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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